全国性DNA调查描绘海洋变化
海水中的DNA痕迹显示,沿日本海岸向北的区域发现了126种鱼类,其分布范围超出以往记录,为研究人员详细呈现了海洋栖息地的变化。这项研究汇集了2017年至2024年间在316个地点采集的2,672份样本,其中近1,000份是冲绳科学技术大学(OIST)的研究人员新采集的。
目录
研究结果于2026年10月26日发表在《多样性与分布》期刊上,涉及具有重要商业价值的日本竹荚鱼和黑边石斑鱼,也包括被怀疑会造成海藻床受损的褐篮子鱼。对沿海社区来说,变化影响的不只是渔网中出现了哪些鱼类,还关系到商家能卖什么、家庭做什么菜,以及哪些栖息地能够支撑未来的渔获。
日本水产厅提供了鲜明的气温背景。该厅的2024财年水产白皮书指出,截至2024年左右的过去约100年间,日本沿海海表温度以每世纪升高1.33摄氏度的速度上升。2024年,日本沿海海表年平均温度创下有记录以来的最高值。
这项OIST研究题为《覆盖日本全国的环境DNA调查填补数据空白,揭示日本鱼类分布范围之外的新记录》,利用环境DNA(eDNA)填补鱼类分布知识方面的空白。研究的核心发现是,有证据表明126种鱼类可能出现在此前记录的分布北界之外,为研究人员和渔业管理者提供了值得进一步调查的具体物种与地点。
海水如何揭示难以观察的鱼类
鱼类会在周围水域留下微量遗传物质。研究人员可以采集海水、提取其中的DNA,并读取遗传密码中的特定片段。随后,他们将这些序列与参考数据库进行比对,以识别相关物种。
这就像把指纹与数据库比对:海水中含有痕迹,参考数据库则提供已知身份信息。一份样本可能包含多种鱼类的DNA,因此科学家无需捕捉或看到每一条鱼,就能调查鱼类群落。
在日本开发的MiFish引物让这一过程成为可能。引物是用于靶向特定遗传区域的短DNA片段,实验室设备可据此扩增该区域以供分析。参考序列则是之后用于比对、确定身份的记录。要可靠地识别物种,两者缺一不可。
研究人员称,这是首次将eDNA用于全国范围的此类调查。它与已有方法相辅相成,包括志愿者观察、实地调查、标本采集和适宜栖息地预测。每种方法提供的信息各不相同,成本、覆盖范围和不确定性决定了它们各自适用的场景。
日本为何能开展如此大规模的调查
该研究第一作者、OIST前博士生Ayşe Haruka Oshima Açıkbaş指出,日本对海洋DNA研究的投入为这项工作奠定了基础。对当地海洋动物进行的大量测序,扩充了用于识别鱼类的参考数据库。
Oshima Açıkbaş还介绍了开展采样工作的设施和合作网络:
我们可以使用OIST这里所有必要的DNA测序设施,同样重要的是,我们还可以联系遍布日本的海洋站及其工作人员,与他们开展合作,
当地渔业、环境机构和科学家协助扩大沿海岸线的覆盖范围。团队新采集的近1,000份样本与此前收集的样本合并后,分析范围扩大至来自316个不同地点的2,672份样本。
因此,这个项目既依赖实验室能力,也离不开沿海各地的工作人员。只有在有人采集、处理并送达合适的样本后,测序仪才能识别遗传物质。成熟的海洋站帮助项目在广阔的地理范围内衔接这些环节。
126种鱼类北向记录意味着什么
日本竹荚鱼(D. maruadsi)和黑边石斑鱼(E. fasciatus)都是在此前记录的分布北界之外检测到的商业重要物种。它们的出现让这项调查与可能进入市场、支撑渔业经营的鱼类直接相关。
褐篮子鱼(S. fuscescens)则引发了另一种担忧:人们怀疑它会通过啃食造成海藻床退化。日语中的“磯焼け”(isoyake)指海底海藻床的衰退或消失,而海藻床为其他海洋生物提供食物和栖息地。
在合并后的数据集中,调查识别出数千种鱼类。126这一数字特指在比此前记录更北的地点检测到的物种,并非样本中发现的鱼类总数。
公开介绍的研究细节没有说明这些鱼类超出此前分布北界的具体距离,也没有说明每个物种是否已在当地形成长期种群。对于沿海管理者来说,这些信息很重要,有助于判断在哪些地区开展重复调查或直接观察最有价值。
海水升温与洋流变化构成背景
日本水产白皮书描述了一种已影响渔获的整体变化:偏好温暖水域的鱼类正在向北扩展栖息地和洄游路线;偏好寒冷水域的鱼类则减少了向南进入日本周边海域的数量,其中包括鲑鱼。
洋流也会影响异常高温出现的地点。日本政府表示,黑潮大弯曲这一暖流路线上的大型弯道自2017年以来一直持续存在。2022年秋季以来,黑潮延伸体向北移动,也就是黑潮进入太平洋后的延续部分,促成了三陆近海气温创纪录。
以下关键日期显示了生物采样期与这些变化的重叠情况:
- 2017年:采样期开始,黑潮大弯曲也进入持续阶段。
- 2022年秋季:黑潮延伸体向北移动,促成三陆近海气温创纪录。
- 2024年:采样期结束,日本沿海海表年平均温度创下有记录以来的最高值。
- 2026年10月26日:OIST研究发表于《多样性与分布》期刊。
气温记录描述物理环境的变化,鱼类检测结果则显示在哪些地点发现了遗传痕迹。两类信息结合起来,能够帮助研究人员考察海洋群落如何在长期变暖与主要洋流运动共同影响下沿海岸线发生变化。
不熟悉的渔获为何卖不上价
OIST海洋气候变化研究组负责人、该研究资深作者Timothy Ravasi表示,渔业社区已经感受到渔获变化:
日本各地的渔民已经发现,与几十年前相比,他们捕获的鱼类种类有所不同。
Ravasi谈到了这些变化对人们的影响:新出现的鱼类可能不为消费者熟悉,他们未必知道如何购买、烹饪或食用。与此同时,熟悉鱼类的减少也会让人们更难制作具有地方文化或历史意义的菜肴。渔业经营者还可能需要更换设备、调整技术并学习新的知识。
水产厅记录了一个相关的商业难题:一些新捕获的鱼类售价偏低,因为当地消费者没有食用这些鱼的传统,成熟的销售渠道也尚未建立。鱼类即使已经出现在海里,买家、加工商和零售商仍可能没有做好处理准备。
日本政府正在努力改善这些渔获的加工和流通,并鼓励当地消费。实际挑战贯穿从渔船到餐桌的全过程:捕获一种替代鱼类,只是以此获得稳定收入的第一步。
海藻损失将鱼类迁移与其他渔业联系起来
海藻床让生态影响尤为直观。水产厅表示,水温升高和啃食损害造成海藻床退化,依赖它们作为栖息地或觅食地的物种也因此受到影响。
日本龙虾和鲍鱼等海洋生物的渔获量,随着海藻床退化而下降。因此,食用海藻的鱼类发生变化,也可能影响捕捞完全不同动物的渔业。
在此前记录的分布北界之外发现褐篮子鱼,为研究人员提供了一个值得关注的物种,他们还可以同时监测当地海藻床的状况。将鱼类和栖息地放在一起追踪,有助于沿海管理部门识别啃食压力与水温升高共同出现的区域。
对渔业社区而言,这种联系很直接:海洋食物网中的一个环节发生变化,就可能影响多种渔获。如果只监测正在销售的鱼类,就会忽视那些有助于维持鱼类种群的栖息地变化。
可靠的DNA结果需要仔细核查
日本环境省在其环境DNA调查指南中介绍了这项技术的优势和局限。该指南重点讨论淡水鱼类和两栖动物,并依据截至2024财年的相关知识编写,同时引用海洋案例,展示这项技术能够检测多少物种。
指南引用的一项全国性沿海鱼类调查在521个属、136个科中检测到1,220种鱼类。一项水族馆验证实验则检测到168种海洋鱼类,占水族箱中饲养鱼类总数的90%以上。这些是展示该方法表现的不同案例,调查场景和统计总数各不相同。
指南要求仔细核查物种清单。样本处理或实验室操作过程中的污染可能造成假阳性,即将DNA归属于调查地点实际上并不存在的物种。假阴性则是指调查地点有某种物种,却未能检测到,包括引物无法有效匹配其DNA的情况。
当地环境也会影响结果。水流、洋流方向、水深、温度、水质以及目标物种的密度都可能影响检测。样本中的某些物质还会干扰PCR,也就是在实验室中扩增特定DNA片段、使其数量足以供分析的过程。
对于同时识别多种物种的广泛调查,指南指出,研究人员无法根据结果计算每个物种的生物量。生物量指生物体的总质量。因此,渔业管理者还需要其他测量数据来评估鱼类数量,并结合DNA证据了解物种分布。
从更广阔的分布图迈向更好的决策
Oshima Açıkbaş及其同事计划开发预测模型,解释DNA为何会出现在特定地点,以及这一现象是如何形成的。这类模型将帮助研究人员把检测过程与影响该过程的海洋环境联系起来。
扩大参考数据库并重复采样,能够提升未来对比分析的价值。记录不断积累,科学家就能更好地追踪同一地点的变化、核查异常检测结果,并找出需要进一步实地调查的区域。
环境省建议将eDNA与传统捕捞和目视调查结合起来,以获取更多信息。这一做法有助于应对日本沿海面临的实际决策:在哪里监测新出现的鱼类、如何应对海藻床损失,以及如何帮助渔业经营者适应渔获变化。
OIST的研究提供了一幅范围广阔的基础分布图。要让这幅图对政策制定有所助益,就需要将其与温度记录、栖息地调查以及渔业社区的经验结合起来,使应对措施既反映生态变化,也兼顾海上从业者的实际需求。
要点
- OIST研究人员发现DNA证据显示,126种鱼类出现在以往记录分布范围以北的区域。
- 研究分析了2017年至2024年间在316个地点采集的2,672份样本。
- 日本竹荚鱼、黑边石斑鱼和褐篮子鱼等物种被发现于此前记录的分布北界之外。
- 日本沿海海表年平均温度在2024年创下有记录以来的最高值。
- 如果缺乏消费者需求和销售网络,不熟悉的渔获可能卖不上价。
- 仔细的实验室核查与传统调查有助于将DNA检测结果转化为渔业和栖息地管理所需的实用信息。






